Para la temporada 2011-12, el Villarreal supera la ronda previa de la UEFA Champions League, venciendo al Odense BK danés por un global de 3-1 y accediendo así a la fase final del torneo; pero en la fase de grupos queda encuadrado dentro del «Grupo de la Muerte» y acaba último, con 0 puntos, tras competir contra rivales tales como Manchester City, Nápoles y Bayern de Múnich. El equipo ya no dependía de sí mismo, fruto de las derrotas ante Gent y Zenit con el anterior técnico, Nuno, y necesitaba ganar y esperar que el Gent no ganase su partido, pero ninguna premisa se cumplió porque los belgas ganaron su partido y el Valencia perdió 0-2 frente al Lyon, quedando así 3º de grupo y por tanto eliminados de la Champions, pasando a disputar la Europa League.
